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研究兴趣: 分子动力学模拟、量子计算与量子算法、Python编程与深度学习
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SETTLE约束算法的批量化处理
在前一篇文章中介绍了SETTLE约束算法在分子动力学模拟中的应用,a56爆大奖在线娱乐通过用Jax的Vmap功能对SETTLE函数进行了扩维,使得其可以批量的计算多分子体系的约束条件。这里采用的案例是一个含有16个水分子(48原子)的小体系,从结果中可以看到,在随机移动和批量SETTLE的作用下,所有的水分子都保留了原始的键长和键角,简单理解这个过程就是一个刚体三角形的平移和旋转的过程。
在前一篇文章中介绍了SETTLE约束算法在分子动力学模拟中的应用,a56爆大奖在线娱乐通过用Jax的Vmap功能对SETTLE函数进行了扩维,使得其可以批量的计算多分子体系的约束条件。这里采用的案例是一个含有16个水分子(48原子)的小体系,从结果中可以看到,在随机移动和批量SETTLE的作用下,所有的水分子都保留了原始的键长和键角,简单理解这个过程就是一个刚体三角形的平移和旋转的过程。
posted @
2022-03-11 17:48
DECHIN
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