MindSponge分子动力学模拟——定义一个分子系统（2023.08）

a56爆大奖在线娱乐通过解析MindSponge的源码实现，详细介绍了在MindSponge中Molecule基础分子类的内置属性和内置函数，以及三种相应的分子系统定义方法：a56爆大奖在线娱乐们既可以使用yaml模板文件来定义一个分子系统，也可以从mol2和pdb文件格式中直接加载一个Molecule，还可以直接使用python列表的形式传入一些手动定义的内容，直接构建一个Molecule。有了最基础的分子系统之后，后面就可以开始定义一些能量项和迭代器，开始分子动力学模拟。
posted @ 2023-08-30 16:53  DECHIN  阅读(317)  评论(0)  编辑  收藏  举报